Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BHLHE41Q9C0J9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms