Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP4AQ9BY43 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms