Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PHF7Q9BWX1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms