Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT27Q9BW83 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IFT27Q9BW83 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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