Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RHOXF2Q9BQY4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms