Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms