Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DCLRE1CQ96SD1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCLRE1CQ96SD1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms