Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSMCE2Q96MF7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms