Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC7Q96M83 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms