Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms