Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RNFT2Q96EX2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms