Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HDAC11Q96DB2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms