Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SPTSSAQ969W0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms