Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRUQ92729 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRUQ92729 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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