Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC4Q8WW27 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms