Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHTF18Q8WVB6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms