Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TMIEQ8NEW7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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TMIEQ8NEW7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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TMIEQ8NEW7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIEQ8NEW7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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