Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PIK3C3Q8NEB9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3C3Q8NEB9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms