Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
USP17L1Q7RTZ2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms