Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SV2AQ7L0J3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SV2AQ7L0J3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms