Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM72Q6ZMU5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms