Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms