Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC174Q6PII3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC174Q6PII3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms