Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZCCHC12Q6PEW1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms