Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TYW3Q6IPR3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TYW3Q6IPR3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms