Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATG16L1Q676U5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATG16L1Q676U5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms