Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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C9orf135Q5VTT2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C9orf135Q5VTT2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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