Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEF20Q5VT98 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms