Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LGSNQ5TDP6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms