Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP188Q5SRE5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms