Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TDRD12Q587J7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms