Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TTLL9Q3SXZ7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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