Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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