Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECM1Q16610 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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