Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F4Q16254 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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