Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ZNF56Q15929 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms