Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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VAMP3Q15836 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP3Q15836 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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