Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TWIST1Q15672 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms