Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIP4Q15650 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIP4Q15650 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms