Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TAF11Q15544 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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TAF11Q15544 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TAF11Q15544 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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