Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TAF13Q15543 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TAF13Q15543 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TAF13Q15543 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TAF13Q15543 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms