Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RABEP1Q15276 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms