Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3GAP1Q15042 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms