Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCARF1Q14162 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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