Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CKAP5Q14008 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms