Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACACAQ13085 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACACAQ13085 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms