Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CSTF3Q12996 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSTF3Q12996 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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