Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BNIP3Q12983 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms