Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF1Q12946 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF1Q12946 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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