Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BPTFQ12830 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms